package com.xie.leetcode.string;

//187. 重复的DNA序列
//        所有 DNA 都由一系列缩写为 'A'，'C'，'G' 和 'T' 的核苷酸组成，例如："ACGAATTCCG"。在研究 DNA 时，识别 DNA 中的重复序列有时会对研究非常有帮助。
//
//        编写一个函数来找出所有目标子串，目标子串的长度为 10，且在 DNA 字符串 s 中出现次数超过一次。
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//
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//        示例 1：
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//        输入：s = "AAAAACCCCCAAAAACCCCCCAAAAAGGGTTT"
//        输出：["AAAAACCCCC","CCCCCAAAAA"]
//        示例 2：
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//        输入：s = "AAAAAAAAAAAAA"
//        输出：["AAAAAAAAAA"]
//
//
//        提示：
//
//        0 <= s.length <= 10^5
//        s[i] 为 'A'、'C'、'G' 或 'T'

import java.util.*;

/**
 * @author xiezhendong
 * @date 2022/1/14
 */
public class FindRepeatedDnaSequences {

    public static void main(String[] args) {
        FindRepeatedDnaSequences findRepeatedDnaSequences = new FindRepeatedDnaSequences();
        System.out.println(findRepeatedDnaSequences.findRepeatedDnaSequences("AAAAACCCCCAAAAACCCCCCAAAAAGGGTTT"));
        System.out.println(findRepeatedDnaSequences.findRepeatedDnaSequences("AAAAAAAAAAAAA"));
    }

    public List<String> findRepeatedDnaSequences(String s) {
        HashMap<String, Integer> keyMap = new HashMap<>();
        for (int i = 0; i <= s.length() - 10; i++) {
            String key = s.substring(i, i + 10);
            Integer num = keyMap.get(key);
            if (num == null) {
                num = 0;
            }
            keyMap.put(key, num + 1);
        }
        List<String> list = new ArrayList<>();
        for (Map.Entry<String, Integer> stringIntegerEntry : keyMap.entrySet()) {
            if (stringIntegerEntry.getValue() > 1) {
                list.add(stringIntegerEntry.getKey());
            }
        }
        return list;
    }
}
